La historia del Archivo Municipal de Mazarrón corre paralela a la existencia de la villa, pues los primeros documentos que se conservan del siglo XVI, hacen referencia a la exención del lugar llamado Casas de los Alumbres de Almazarrón de la jurisdicción de Lorca, y su constitución como concejo con término y jurisdicción propios.

Entre ellos podemos destacar una provisión de 14 de julio de 1546 por la que se comisionaba a Ambrosio Rótulo para que informara sobre esta circunstancia. Los compromisarios se reunieron en la iglesia de la Concepción el 22 de febrero de 1565 para realizar la primera elección de oficios; y el 1 de agosto de 1572 Felipe II concedía la carta de privilegio de villazgo.

Desde entonces todos los acontecimientos históricos se verán reflejados en los documentos aquí custodiados, siendo imprescindible como fuente primaria para el estudio de la historia local.

Siempre ha sido preocupación del concejo conservar todos aquellos testimonios escritos que se fueron produciendo con el devenir de los tiempos pues la cantidad y antigüedad de los mismos así nos lo hace pensar. Los primeros libros capitulares hacen referencia al arca del archivo, y en el cabildo de diecinueve de mayo de 1565, Juan de Albacete designa a Pedro Curado para ir a Murcia con la facultad de comprar patrones de vara de medir como son:

"patron de arroba y de media arroba de medir vino, y patrones de pesas de hierro y patrones de media fanega de palo para medir trigo, y así esta villa se gobierne mejor y se rija por ellos. Y traídos dichos patrones se pongan en el archivo deste cabildo para que en el esten guardados y conservados".

También encontramos noticias de la preocupación por dotar al ayuntamiento de personal encargado del mismo. Datos de ello tenemos en 1897, año en el que se nombra a Miguel López López como archivero municipal, en el año 1906 se nombra como oficial 1º de Secretaría y archivero a Emilio Blesa Muñoz, y en 1914 a Ginés Gómez Granados como archivero interino.

Como instrumentos de descripción de los documentos tenemos dos inventarios, que coinciden con la existencia de archiveros dentro de la plantilla municipal. El primero de finales del siglo XIX, se conserva de forma parcial puesto que se trata de el 2º cuaderno de inventario del archivo de la villa de Mazarrón, no conservándose ninguno más; en él se hace referencia a documentos relativos a guardas jurados, amillaramientos, consumos, alumbramiento de aguas, etc.
El segundo, denominado Habitación del Reloj. Inventario del Archivo. Año 1914, hace una relación de una colección de libros y de documentación relativa a cédulas personales, elecciones, censos, matrícula industrial, tabacos, etc. Entre los siglos XVIII y XX.